Nous sommes en 1878 à Tokyo, dix ans après
que l'Empereur Meiji ait mis fin au Shogunat. Les artisans
de sa restauration au pouvoir occupent désormais
les postes clefs du gouvernement. Cependant, l'un d'entre
eux, qui travaillait dans l'ombre, a refusé cette
voix royale contraire à ses principles.
Cet homme, Battosaï l'assassin, a été
un exécuteur très efficace des basses
oeuvres de l'Empereur mais il a choisi de disparaître
et de devenir Kenshin Himura, un simple vagabond qui
voyage avec son sabre à lame inversée,
une arme qui n'est pas faite pour tuer.
Dans le premier épisode, Kenshin fait la connaissance
de Kaoru Kamiya, une jeune fille de dix sept ans. Elle
est l'héritière d'un dôjô
de kendo et doit perpétuer l'enseignement de
son école, mais tous les élèves
sont partis depuis la mort de son père. Kenshin
intervient pour démasquer un imposteur qui se
fait passer pour Battosaï l'assassin et qui convoite
le dôjô de Kaoru. L'affaire réglée,
elle le convainct de rester pour l'aider à relancer
l'école de kendo.
Au gré des aventures, de nouveaux amis viennent
loger au dôjô. Il s'agit d'abord de Yahiko
Myôjin, un garçon issu d'une pauvre famille
de samouraï mais très fière. Vient
ensuite se joindre à eux Sanosuke Sagara, un
combattant hors pair, mais moins expérimenté
et moins fort que Kenshin.
Le groupe se trouve confronté à des parvenus
sans scrupules et avides de pouvoirs, ainsi qu'à
toute une série d'anciens adversaires de Battosaï,
qui rêvent de vengeance et qui ont repris leurs
activités d'assassins ou d'intriguants